В Калифорнии разбился самый современный истребитель ВВС США

Очень "удачно" он упал. Как раз в ближайшее время собираются рассматривать программу закупки F-22. Но думаю, несмотря ни на что, ещё 60-100 штук конгресс им проплатит, их шуганут "полётом ПАК ФА в августе".

Возможно Вы правы. Однако же могут быть и иные причины.

Могут быть проблемы с композитами - к примеру у амеров есть задумка увеличить нагрузку в скрытом режиме за счет конформных элементов (их ещё в простом варианте на Орле отработали в начале 1990-х).
Либо разбившаяся машина могла иметь какую-то модификацию планера.
Пример: Когди начинали выпускать оперение приклеивалось. В итоге - трупы, т.к. при больших нагрузках впоследствии оно отрывалось. Затем стали использовать болты и катастрофы по этой причине прекратились.

Может были какие-то глюки с системой управления - например при испытании импульсной техники - сейчас есть большая программа по физическим видам оружия, т.к. позволяет избежать размещения почти всех видов боеприпасов - поражающий фактор иной.
Кстати если система катапультирования не сработала так как надо - причиной данного может быть работа именно бортового оборудования.
В сухом остатке - полет был непростым. По крайней мере испытывалось новое оборудование. Что скорее всего. Максимум - были существенные изменения в планере.

Есть ещё момент - оборудование воздействия могло размещатся вне самолета. Например на земле испытания прошли успешно, а в воздухе привело к катастрофе.
Точно не из-за навигации - иначе пилот остался бы в машине.

Главное - погиб человек. Его жалко. Хотя может это затормозит какую-нибудь программу, которая могла бы привести к куда большим жертвам.

Возможно, т.е. при апробации нового ПО. Все же мне кажется что такого рода машины должны иметь на основных управления дублирующие компы, либо системы предотвращающие подобные аварийные случаи. То бишь сбой был сразу в нескольких компьютерах. Т.к. питание стопудово раздельной и буферизованное, то скорее всего какое-то внешнее по отношению к данным системам воздействие.
Вирус и пр. исключены - используемые языки, типа ADA и более последние довольно устойчивы. Да и чтобы все одновременно...
Вы знаете, возможно также следующее - изменилась развесовка и (или) аэродинамическая схема каким-либо сложным образом так что на определенных режимах полета произошло то о чем Вы говорите.

Есть еще вариант. Довольно фантастичный (но только на первый взгляд).
Возможно то же воздействие, из-за которого разбился Б-2 и Б-1Б был в управляемом извне режиме. Стелсы довольно трудные должны быть во внешнем управлении машины - все схемы аэродинамически неустойчивы - чай истребитель-таки, к тому же во имя невидимости пусть меньше чем на других машинах, но пожертвовали аэродинамикой.
Да и самии системы управления достаточно нетривиальны.
Ghost ex mashina!

Кстати последнее возможно и на наших машинах, т.е. некое слабое внешнее воздействие, проявляющееся в нестабильности работы ряда систем.